该研究针对研究较少的代谢物,开创性的提出了一系列生信分析策略,提示代谢物与所研究疾病之间可能的关联,为代谢组学研究提供新思路。
1月17日,佛山市第一人民医院(下称“市一医院”)陈国强院长团队在国际顶级学术期刊《Gut》(IF 31.793;JCR 1区)发表题为“An in silico method to maximise the biological potential of understudied metabolomic biomarkers: a study in preeclampsia”的学术论文。该论文的发表标志着市一医院科研实力再上新台阶。
肠道微生态是陈国强院长近年来致力的重要研究方向,肠道代谢物是肠道环境的重要组成部分,被认为是肠道微生物与宿主沟通互作的媒介。进入组学研究时代以来,代谢组学研究中有个普遍困扰研究人员的问题,那就是由于注释的代谢物中只有非常小的比例得到了充分的研究,研究者经常会得到几乎没有先前报道的标志物,降低了研究人员选择最重要的生物标志物的信心,导致许多团队倾向于选择已经有许多背景知识的标志物进行研究,从而阻碍了新靶标的发现,这很大程度上阻碍了领域的创新。
市一医院研究团队在陈院长的带领下开发了一套分析策略用以解决上述问题,并且以子痫前期(preeclampsia)为例,展示了组学分析+初步实验验证的过程。团队骨干成员妇产科陈夏博士前期研究发现肠道菌群失调在子痫前期发病中发挥重要作用,研究成果在2020年发表在《Gut》杂志上。为进一步探究肠道菌群参与子痫前期发病的具体机制并挖掘具有治疗潜力的靶标,团队通过非靶向代谢组学技术发现芒柄花酚(Ononetin)在子痫前期患者肠道显著下降。该研究针对研究较少的代谢物,开创性的提出了一系列生信分析策略,提示代谢物与所研究疾病之间可能的关联,为代谢组学研究提供新思路。
该研究是市一医院牵头开展的项目,受国家自然科学基金,广东省科技计划项目以及博士后基金资助。论文共同第一作者为佛山市第一人民医院妇产科张四友主任和郑慧敏博士、华南师范大学麦飞鸿博士;佛山市第一人民医院陈国强院长、陈夏博士、冯颖琳博士为共同通讯作者。
供稿:妇产科编辑:孙凯审核:陈润钿
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