Nature Genetics | 揭示炎症性肠病的遗传特征

炎症性肠病（IBDs）是胃肠道的慢性疾病，有以下两种亚型：克罗恩病（CD）和溃疡性结肠炎（UC）。迄今为止，大多数IBD基因关联来自欧洲（EUR）血统的个体。

2023年5月8日，同济大学刘占举、广州医科大学李明松、哈佛医学院黄海亮、日本东北大学Yoichi Kakuta及韩国蔚山大学Kyuyoung Song共同通讯在Nature Genetics（IF=41）在线发表题为“Genetic architecture of the inflammatory bowel diseases across East Asian and European ancestries”的研究论文，该研究揭示了东亚和欧洲血统的炎症性肠病的遗传结构。

炎症性肠病（IBDs）是一组慢性、使人衰弱的胃肠道疾病，发病高峰出现在青少年和成人早期。截至2017年，全球有680万人被诊断为IBD ，全球发病率和患病率不断上升，尤其是在最近工业化的国家。IBD有以下两种病因相关的亚型：克罗恩病（CD）和溃疡性结肠炎（UC）。全基因组关联研究（GWAS）发现了240多个与IBD相关的遗传位点。然而，到目前为止，大多数IBD基因关联都是使用欧洲（EUR）血统的个体得出的，只有少数研究在非EUR人群中，但其样本量要小得多。此外，来自EUR的基因发现可能不适用于非EUR，他们总共占世界人口的88%。例如，NOD2是第一个报道的和公认的CD风险基因，在EUR的9个假定的罕见或低频IBD因果变异中，其复合等位基因频率（AF）为13%。这九种变体在EAS中的复合AF仅为0.06%，这表明受这些公认的IBD因果等位基因影响的EAS血统个体要少得多。相比之下，TNFSF15在EAS中增加CD风险的幅度远大于EUR6，这一尚未解释的差异可能是由临床异质性或基因-环境/基因-基因相互作用驱动的。因此，一项跨血统的IBD基因比较研究可能会揭示有趣的IBD生物学，并确定血统特异性和共享的生物成分和治疗靶点，以确保基因发现可以减少而不是扩大健康差异。

IBD基因关系图（图源自Nature Genetics ）

该研究报告了对东亚（EAS）血统个体进行的最大规模的IBD研究，包括14393例病例和15456例对照。研究人员仅在EAS中就发现了80个IBD基因座，在对约370000 EUR个体（约30000例）进行荟萃分析时发现了320个，其中81个是新的。富含EAS的编码变体涉及许多新的IBD基因，包括ADAP1和GIT2。尽管IBD的遗传效应在各个血统中通常是一致的，但CD的遗传基础似乎比UC更依赖于血统，这是由等位基因频率（NOD2）和效应（TNFSF15）驱动的。该研究通过合并两种血统来扩展IBD多基因风险评分（PRS），大大提高了其准确性，并强调了多样性对PRS公平部署的重要性。