该研究分析了NK细胞的免疫特性,并鉴别了HBV感染不同分期中参与NK细胞转录调控的转录因子,为慢性HBV感染的抗病毒免疫机制提供了新的见解。
编者按: 第74届美国肝病研究学会年会(AASLD 2023)将于当地时间2023年11月10日 - 14日在美国波士顿召开。 自然杀伤细胞(NK)是抗病毒免疫应答的重要效应细胞。在HBV感染中,NK细胞的表型和功能会发生改变。吉林大学第一医院的牛俊奇教授团队在AASLD2023大会摘要中公布的一项研究探讨了HBV感染不同阶段NK细胞免疫特性的变化情况,结果显示HBV感染者的肝脏NK细胞和外周血NK细胞均显著降低,并且经典NK细胞(cNK)和肝脏驻留NK细胞(LrNK)具有不同的表型和功能,在HBV感染的不同分期中cNK细胞比例显著降低,而LrNK细胞比例显著升高。
研究方法 研究方法
本研究分析HBV感染患者的NK细胞单细胞RNA测序(ScRNA-seq)数据(GSE182159),包括6例免疫耐受(IT)期,5例免疫活动(IA)期,3例免疫清除(CR)期患者和6例健康对照者。通过Seurat分析和时序分析鉴定NK细胞簇及其亚型。通过富集分析研究不同类型NK细胞的功能。通过hdWGCNA和WGCNA分析CD56+NK细胞的大量RNA-seq数据(GSE125686),并结合scRNA-seq数据探讨NK细胞在HBV感染不同阶段的转录组谱变化及潜在的转录调控因子。
研究结果
与健康对照相比,HBV感染者的肝脏NK细胞(特别是IA期)和外周血NK细胞(特别是CR期)均显著降低。此外,在IT患者中观察到肝脏NK细胞中细胞毒性基因的表达受损。
亚聚类和时序分析显示,经典NK细胞(cNK)和肝脏驻留NK细胞(LrNK)具有不同的表型和功能,在HBV感染的不同分期中cNK细胞比例显著降低,而LrNK细胞比例显著升高。
最后,在肝脏NK细胞中鉴定出4个与IT期相关的转录因子(YBX1、ID2、CNBP和HOPX)和6个与IA期相关的转录因子(BACH2、MYC、NFKB2、SMAD3、IRF8和RERE)。
研究结论
该研究分析了NK细胞的免疫特性,并鉴别了HBV感染不同分期中参与NK细胞转录调控的转录因子,为慢性HBV感染的抗病毒免疫机制提供了新的见解。
肝霖君有话说
NK细胞可通过直接的细胞毒性或分泌细胞因子发挥抗病毒作用,越来越多的研究证明NK细胞在慢乙肝的治疗中发挥重要作用。已有研究显示聚乙二醇干扰素α(PEG IFNα)可以大幅提高核苷经治患者的临床治愈率可能得益于CD56bright NK细胞的活性增加。PEG IFNα治疗可显著提高慢乙肝患者NK细胞的频率和功能,且基线和12周的NKp46bright NK细胞频率与治疗48周时HBsAg下降显著相关。此外,经PEG IFNα治疗获得临床治愈的患者的CD56bright NK%与HBV DNA水平呈负相关。本研究对NK细胞的免疫特性以及对参与NK细胞转录调控的转录因子的探索,为慢性HBV感染的抗病毒免疫机制提供了新的方向。
参考文献:
Liu Y, Niu J. Combination of single-cell and bulk RNA-seq reveals immune characteristics of NK cells in different stages of chronic HBV infection. AASLD2023, Abstract (1495-C).
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